基因组分子生物学加速食道癌筛查

食道癌是世界性第八大最常见的肝癌。对于这种类型的肝癌，这两项的监控和治疗法工具更为加麻烦，许多病患只能经过时日的机制才能保障不必缺失任何恶化的可能会性。

科学研究其他部门现在仍然开发出新一种统计资料框架，该框架常用基因组数据资料来正确预测身患Barrett食道症状的病患进一步恶化的可能会性高高。

剑桥大学，EMBL的欧洲分布式计算科学研究室（EMBL-EBI）的科学研究其他部门和合作者对如前所述收集自Barrett食道病患的切除该组织的基因组来进行了PCR。监控这些病患的食道癌后期精神状态。科学研究其他部门常用这些数据资料找出事与愿违被检验出新身患肝癌的病患与未检验出新肝癌的病患间的关联性。数据资料主要用途建立联系测量每个病患其所可能会性的统计资料框架。该科学研究发表在《Nature Medicine》杂志上。

最近的其他肝癌科学研究表明，造成肝癌的基因组变异可能会遭遇在病患被检验出新肝癌之此前很多年。并能识别这些变异可能会为后期检验和治疗法缺少新途径。

科学研究其他部门常用来自88位Barrett食道病患的基因组数据资料，具体了在检验此前八年以上被检验出新食道癌的病患中的有一半为“高可能会性”。检验此前两年，这一数字上升了70％。比方说是举足轻重的是，该框架还可以正确地预测肝癌的可能会性极高的病患。

EMBL-EBI小组负责人Moritz Gerstung表述说是：“这项科学研究的鲜明之一处之一就是剑桥Addenbrooke养老院的同事缺少的数据资料丰富。” “这些病患仍然给与了超过15年的防范，因此，随着时间的很长，我们从食道的不尽相同周边共计挖掘出了800多个样本。这使我们并能更为详细地测量什么类型的基因组变异以及这些轨迹如何变异在没有肝癌的病患和没有肝癌的病患间来进行。如果没有如此详尽的监控计划，这项科学研究将不可能会来进行。

尽管身患Barrett食道的人比一般一些人患食道癌的可能会性要高得多，但每年300名病患中的只有1名被检验出新身患肝癌。尽管如此，他们都只能每两年来进行一次侵入性防范机制。这种防范对于病患而言可能会是不不快的，尴尬的并且费时的，并且给医疗卫生管理系统带来了额外的负荷。

“我们工具的好一处是双重的，” EMBL-EBI的客座博士后Sarah Killcoyne表述说是。 “身患高危Barrett病且可能会增生的病患可以更为早给与治疗法。那些持有某种遗传上比较稳定的好像且不太可能会发展为该肝癌的人不须来进行如此严格的防范。希望我们的工具可以帮助有所改善后期发现和治疗法，并减少高可能会性病患的故意治疗法，而不必损害病患的安全及。”

这些结果意味着一处于高可能会性的病患可以立即得到治疗法，而不是来进行重复的活该组织体检直到发现肝癌的后期精神状态为止。相反，高可能会性和肝癌比较稳定的病患可以较少地来进行监控。总体而言，作者估计可以减少50％的Barrett食道病患的监控。

作者说是，下一步是完善该工具，比较好是分析更为多病患的数据资料。引入临床信息并提升框架的正确度也很举足轻重。（生物谷 Bioon.com）

资讯出新一处：Genome sequencing accelerates cancer detection

原始出新一处：Genomic copy number predicts esophageal cancer years before transformation， Nature Medicine (2020). DOI： 10.1038/s41591-020-1033-y ， www.nature.com/articles/s41591-020-1033-y